110G HiFi data/cell！诺禾致源Revio平台实测数据精彩呈现
2023-05-10 14:49:53 诺禾致源
诺禾致源已顺利安装PacBio Revio测序平台，第一批项目数据质控结果显示，Revio测序平台产出优秀，单个SMRT cell最高产出高达110.5G。随着Revio平台的引入，诺禾致源三代测序通量增强，交付速度进一步加快，我们将依靠强大、稳定的实验平台携Revio为您带来DNA HiFi建库测序7天极速交付周期。
01
Revio平台单个SMRT cell产量情况
(资料图片)
Revio平台展示了自己在数据产出方面的强大实力。在第一批交付项目中，平均每个SMRT cell产出98.4G。数据平均质量值达到Q31.2。其中动物样本每个SMRT cell产出均大于90G，植物多糖多酚样本，产出86.4Gb。
表1 Revio测序数据质量汇总
02
Revio平台混样测序
在单个cell混样上机的测试中，将三个动物样本和三个植物样本分别进行文库等量混样上机测序，测序数据分析结果显示：样本数据拆分效率及产出均一性均表现良好，混样测序数据拆分率均达到99%以上，动物单个样本产出数据量达到30G以上。
表2 Revio平台混样测序数据质量汇总
03
Revio平台 vs Sequel II平台
PacBio Sequel II与Revio平台测序数据对比分析：利用同一样本进行平台测序对比测试，每个测序平台测序1个cell。结果显示，Revio平台相比Sequel II平台，每张SMRT cell的HiFi data产量提升2-3倍，且测序时间更短，数据平均质量值达Q30以上。Revio平台将实现DNA HiFi建库测序7天交付。依据其各方面优越性能在科学研究中将会有更加广阔的应用前景。
表3 PacBio Sequel II与Revio平台数据比对
04
人全基因组重测序 30XHiFi数据分析结果
以人样本为例对Revio平台测序数据进行参考基因组比对及分析，得到比对率99.91%，覆盖度达99.64%，同时大片段结构变异检出率高。HiFi长读长技术的应用，揭示了长片段结构变异的特点，实现了高重复区域的无偏好性测序，为疾病诊断与治疗，尤其是遗传病和罕见病致病机理的研究提供了一种创新的技术解决方案。Revio平台的质优价廉将为今后疾病高效诊断提供助力。
表4 人类样本Revio平台测序数据比对率、覆盖度、测序深度统计
图1 人全基因组重测序（WGS）数据分析结果
注:图1.1结构变异长度统计；图1.2 circos图为变异染色体分布密度展示，从内到外依次为：translocation,insertion,deletion ,inversion ,cnv,str ,gene,染色体
在全球范围内，诺禾致源基因组项目覆盖面广泛，积累了大量物种的三代建库测序及生物信息学分析经验，凭借在de novo测序技术和应用方面的明显技术优势，已经累计获得专利授权18项、软件著作权40余项，并在国际期刊合作发表署名论文109篇，累计影响因子超过1100。作为目前国内基因测序领域的佼佼者，未来，诺禾致源将继续发挥其专业优势，为全球科研工作者提供丰富的项目经验和优质高效的服务，为推动基因组研究做出更大的贡献。
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